คณะอนุกรรมการอนุสัญญาว่าด้วยความหลากหลายทางชีวภาพ เดิมตั้งขึ้นโดยคณะกรรมการสิ่งแวดล้อมแห่งชาติ ในปี พ.ศ. 2536 ซึ่งมีปลัดกระทรวงเกษตรและสหกรณ์ เป็นประธาน และสำนักงานนโยบายและแผนทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม เป็นฝ่ายเลขานุการ

     ต่อมา คณะอนุกรรมการอนุสัญญาว่าด้วยความหลากหลายทางชีวภาพแต่งตั้งขึ้นตามความในหมวดที่ 1 แห่งระเบียบสำนักนายกรัฐมนตรีว่าด้วยการอนุรักษ์และใช้ประโยชน์ความหลากหลายทางชีวภาพ พ.ศ. 2543 ข้อ 9 (10) ว่าด้วยอำนาจหน้าที่คณะกรรมการอนุรักษ์และใช้ประโยชน์ความหลากหลายทางชีวภาพ ได้มีคำสั่งคณะกรรมการอนุรักษ์และใช้ประโยชน์ความหลากหลายทางชีวภาพแห่งชาติ ที่ 1/2549 เรื่อง แต่งตั้งคณะอนุกรรมการอนุสัญญา
ว่าด้วยความหลากหลายทางชีวภาพ ลงวันที่ 23 กุมภาพันธ์ พ.ศ. 2549 เเละในปี พ.ศ. 2557 ได้มีคำสั่งคณะกรรมการอนุรักษ์เเละใช้ประโยชน์
ความหลากหลายทางชีวภาพแห่งชาติ ที่ 4/2557 เรื่องเเต่งตั้งคณะอนุกรรมการอนุสัญญาว่าด้วยความหลากหลายทางชีวภาพ ลงวันที่ 25 ธันวาคม 2557 เพื่อให้องค์ประกอบของคณะอนุกรรมการฯมีความสอดคล้องกับสถานการณ์ปัจจุบันและครอบคลุมหน่วยงานที่เกี่ยวข้องกับการดำเนินงานตามพันธกรณีของอนุสัญญาว่าด้วยความหลากหลายทางชีวภาพ โดยให้ยกเลิกคำสั้งคณะกรรมการอนุรักษ์และใช้ประโยชน์ความหลากหลายทางชีวภาพแห่งชาติ ที่ 1/2549 ลงวันที่ 23 กุมภาพันธ์ พ.ศ. 2549 ซึ่งองค์ประกอบของคณะอนุกรรมการอนุสัญญาว่าด้วยความหลากหลายทางชีวภาพในปัจจุบัน มีจำนวน 28 ท่าน
ประกอบด้วย ปลัดกระทรวงทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม เป็นประธานอนุกรรมการ ผู้แทนหน่วยงานภาครัฐ 21 หน่วยงาน ผู้ทรงคุณวุฒิจำนวน 3 ท่าน เลขาธิการสำนักงานนโยบายและแผนทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม เป็นอนุกรรมการและเลขานุการ และผู้อำนวยการสำนักความหลากหลายทางชีวภาพและหัวหน้ากลุ่มงานเลขานุการคณะกรรมการฯ เป็นอนุกรรมการและผู้ช่วยเลขานุการ

อำนาจหน้าที่

• ดำเนินการให้ประเทศไทยมีการอนุรักษ์และใช้ประโยชน์ความหลากหลายทางชีวภาพโดยสอดคล้องกับพันธกรณีอนุสัญญาว่าด้วยความหลากหลายทางชีวภาพ และข้อมติของสมัชชาภาคีอนุสัญญาว่าด้วยความหลากหลายทางชีวภาพ
• ประสานความร่วมมือกับหน่วยงานต่างๆ ทั้งภายในและต่างประเทศในการอนุวัตตามอนุสัญญาว่าด้วยความหลากหลายทางชีวภาพ
• เตรียมการประชุมสมัชชาภาคีอนุสัญญาว่าด้วยความหลากหลายทางชีวภาพ การประชุมคณะที่ปรึกษาทางวิทยาศาสตร์วิชาการและเทคโนโลยีและการประชุมอื่นๆภายใต้อนุสัญญาฯ
• จัดทำนโยบาย มาตรการและแผนการอนุรักษ์และใช้ประโยชน์ความหลากหลายทางชีวภาพอย่างยั่งยืน
• กำกับ ดูแล และติดตามการดำเนินงานด้านความหลากหลายทางชีวภาพของประเทศให้เป็นไปตามนโยบาย มาตรการและแผนการอนุรักษ์และใช้ประโยชน์ความหลากหลายทางชีวภาพอย่างยั่งยืน
• แต่งตั้งคณะทำงานในการดำเนินงานด้านความหลากหลายทางชีวภาพตามความเหมาะสม
• ดำเนินการอื่นๆ ตามที่ได้รับมอบหมายจากคณะกรรมการอนุรักษ์และใช้ประโยชน์ความหลากหลายทางชีวภาพแห่งชาติ

คำสั่งคณะกรรมการอนุรักษ์และใช้ประโยชน์ความหลากหลายทางชีวภาพแห่งชาติ ที่ 1/2549

คำสั่งคณะกรรมการอนุรักษ์เเละใช้ประโยชน์ความหลากหลายทางชีวภาพแห่งชาติ ที่ 4/2557